高壓柱塞泵是高效液相色譜儀的重要單元部件，用于將流動相和樣品輸入到色譜柱和檢測器中，從而使樣品得以分析，其性能的好壞直接影響整個儀器和分析結果的可靠性。
為了使流動相輸入和輸出的過程完成，柱塞桿需在泵頭內做往復運動。藍寶石，不銹鋼以及復合材料是柱塞桿常用的材料。一些比較特別的領域通常使用其它材質柱塞桿。柱塞桿在泵頭內做往復運動，而流動相不漏出來是由于柱塞桿密封圈的作用。密封圈在泵頭被緊緊地鉗著。因此會有非常嚴重的磨損，密封圈是通過惰性材料石墨摻和聚四氟乙烯粉制作而成，其具有不一樣的兩面，一面有彈簧，對墊圈內邊包裹柱塞桿相當的有幫助，在安裝的時候，使彈簧面向泵頭腔體。
在吸液過程中，因為柱塞桿向后運動而使得負壓在泵腔中形成。由于存在色譜柱等部件，和泵頭內相比，泵頭外的壓力明顯要更高，在這兩種壓力差下，出口單向閥的寶石球往閥座上落回。而對于進口單向閥，由于外界壓力加上管路壓力比泵腔的壓力要大，寶石球從閥座離開，泵腔內吸入流動相。
在輸液過程中，因為柱塞桿向前運動增加了壓力，進口單向閥的寶石球往閥座上落回，閥處于關閉狀態，流動相不可以往泵腔內流入，同時，出口單向閥的寶石球從閥座離開，輸送出了泵腔內的流動相。這樣反復，流動相通過泵向液路系統連續不斷地輸送。
液相色譜儀中運動部件較多，機械磨損較嚴重，很容易出故障的儀器都是色譜泵，所以只有清楚的了解色譜泵的各個部分從而降低故障的發生率，才能夠使泵的安全運轉得到保障。
柱塞桿故障排除
劃痕、磨蝕、卡住、折斷、劃痕、磨損為比較常見的故障，在柱塞桿與密封圈之間有有磨損物質或者緩沖溶液析出的鹽。
現象:如果柱塞不能動,不能打流動相，那么值得留意的是遇到這種情況不能將泵打開，不然會將電機燒壞從而導致泵受到損壞。
現象:無流動相輸出,壓力波動卡住，在泵中留有腐蝕性溶劑又幾天不開是主要的原因。
現象:就算將密封圈更換掉也不能夠使得滲漏停止，劃痕通過放大鏡能夠觀察到，通常在對密封圈檢修時會發生折斷
現象:即便更換密封圈也不能止住滲漏,用放大鏡可觀察到劃痕。折斷一般是發生在檢修密封圈時
上述三種現象均需要對柱塞桿進行更換，而更換柱塞桿并不簡單，建議請維修人員來更換。
